ChEBI
| Konten | |
|---|---|
| Deskripsi | Database kimia |
| Jenis data | Chemical Entities of Biological Interest |
| Kontak | |
| Pusat penelitian | European Molecular Biology Laboratory |
| Laboratorium | |
| Kutipan utama | [1] |
| Akses | |
| Situs web | ChEBI |
| URL pengunduhan | Downloads |
| URL layanan web | Web Service |
| Endpoint Sparql | BIO2RDF |
| Perangkat | |
| Web | ChEBI Website |
| Lain-lain | |
| Frekuensi rilis data | bulanan |
| Kebijakan kurasi | Manually curated |
ChEBI adalah singkatan dalam bahasa Inggris dari Chemical Entities of Biological Interest (Entiti kimia yang mempunyai kaitan menarik dengan biologi),[1][2] yaitu suatu database dan ontologi entiti molekuler yang berfokus pada senyawa kimia 'kecil', yang merupakan bagian dari upaya Open Biomedical Ontologies. Istilah "entiti molekuler" ("molecular entity") merujuk kepada apapun, yang berupa "atom, molekul, ion, pasangan ion, radikal, ion radikal, kompleks, konformer, dsb. yang berbeda secdara konstitutional atau isotopik, dapat diidentifikasi sebagai suatu entiti yang bisa dibedakan secara terpisah".[3] Entiti molekuler ini dapat merupakan produk alamiah ataupun produk sintetik yang memiliki potensi bioaktivitas. Molekul-molekul yang secara langsung dikodekan oleh genom, misalnya asam nukleat, protein dan peptida diturunkan dari pemotongan (cleavage) proteolitik, menurut aturannya tidak dimasukkan ke dalam ChEBI.
ChEBI menggunakan nomenklatur IUPAC, yaitu simbolisme dan terminologi yang dipakai oleh International Union of Pure and Applied Chemistry (IUPAC) dan Nomenclature Committee dari International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB).
Skop dan Akses
Semua data dalam database adalah non-proprietary atau diturunkan dari suatu sumber non-proprietary. Jadi dapat diakses dan tersedia secara bebas bagi semua orang. Lagipula, setiap item data dapat dilacak penuh dan secara eksplisit dirujuk ke sumber asalnya.
Data ChEBI tersedia melalui suatu "public web interface", Web Service dan download.
Lihat pula
Referensi
- ^ a b De Matos, P.; Alcantara, R.; Dekker, A.; Ennis, M.; Hastings, J.; Haug, K.; Spiteri, I.; Turner, S.; Steinbeck, C. (2009). "Chemical Entities of Biological Interest: An update". Nucleic Acids Research. 38 (Database issue): D249–54. doi:10.1093/nar/gkp886. PMC 2808869. PMID 19854951.
- ^ Degtyarenko, K.; De Matos, P.; Ennis, M.; Hastings, J.; Zbinden, M.; McNaught, A.; Alcantara, R.; Darsow, M.; et al. (2007). "ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D344–50. doi:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057.
- ^ IUPAC, Compendium of Chemical Terminology, edisi ke-2 ("Buku Emas") (1997). Versi koreksi daring: (2006–) "molecular entity".
Pranala luar
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.