أسس النادي في 15 أغسطس، 1916 في مدينة غوادالاخار، وسُمي أطلس نسبةً إلى إله الميثولوجيا الإغريقي. حقق النادي تسعة بطولات محلية: لقب الدوري المكسيكي الممتاز (1950-51)، 4 ألقاب كأس المكسيك (1945-46، 1949-50، 1961-62، 1967-68)، 4 ألقاب بطل الأبطال (1946، 1950، 1951، 1960).
يلعب نادي أطلس مبارياتهُ في ملعب خاليسكو الذي يُعد ثالث أكبر ملعب في المكسيك، شُيد في 31 يناير، 1960 و يتسع لأربعة وخمسين ألف مشجع. استضاف الملعب عدة مباريات دولية تاريخية، حيث استضاف 8 مباريات من نهائيات كأس العالم لكرة القدم عام 1970، 6 منهم كانت مباريات دور المجموعات، ومباريتين من الدور النصف النهائي. و استضاف بعدها 9 مباريات من نهائيات كأس العالم عام 1986، 6 منها كانت مباريات دور المجموعات، ومباراة واحدة من دور الستة عشر، مباريتين من الدور النصف النهائي.
أكاديمية النادي
عرف نادي أطلس بنجاح أكاديميتهُ للشباب إذ تخرج منها العديد من اللاعبين الذين نجحوا في مسيرتهم محلياً ودولياً، خرجت الاكاديمية لاعبين محترفين شاركوا في تشكيلة المنتخب الوطني المكسيكي مثل:
الملابس الحالية للفريق من تصنعها شركة بوما الألمانية للملابس الرياضية، وتظهر علامة شركة بريجستون الأمريكية لإطارات السيارات، وعلامة قناة أزتيكا التلفزيونية على ملابس الفريق.
