Il poursuivit tout de même avec l'université du Dakota du Nord jusqu'en 1983, remportant au passage le championnat inter-universitaire de la NCAA en 1981-1982. N'ayant pas été en mesure de s'entendre avec les Whalers, c'est à titre d'agent libre qu'il rejoint les Komets de Fort Wayne de la ligue internationale de hockey pour la saison 1983-1984. Il rafle au terme de cette saison le trophée Garry-F.-Longman remis au meilleur joueur recrue ainsi que le trophée James-Gatschene remis au joueur par excellence de la saison régulière.
Ses résultats au cours de cette saison intéressent les Flyers de Philadelphie qui décident de lui offrir un contrat. Il rejoint alors pour la saison suivante leur club affilié dans la Ligue américaine de hockey, les Bears de Hershey. Il aura au cours de cette saison l'occasion de prendre part à son tout premier match en LNH, son seul cette année-là.
Après le décès tragique durant l'été 1985 du gardien Pelle Lindbergh ainsi qu'une blessure de Bob Froese survenu en novembre, il obtient un poste permanent avec le grand club. Remportant 15 de ses 29 départs avec les Flyers, il remporte avec Froese le trophée William-M.-Jennings remis aux gardiens de l'équipe ayant accordé le moins de buts en saison régulière.
Avant la date limite des transactions de 1986, les Flyers procèdent à un échange et obtiennent les services du vétéran gardien Glenn «Chico» Resch, Jensen est ainsi retourné aux Bears avec qui il atteindra la finale de la Coupe Calder. Avec l'émergence du jeune Ron Hextall en 1986-1987 Janssen poursuit avec Hershey pour une saison avant d'être échangé au Canucks de Vancouver en 1987 en retour notamment de Wendell Young.
Au terme de la saison 1988-1989, Darren Jesen annonce son retrait de la compétition.