À la suite de l'éclatement de l'ORTF le et de la création de la nouvelle société nationale de programme France-Régions 3 responsable de toutes les chaînes de radio et de télévision régionales, la station est intégrée au sein de FR3 Rhône-Alpes Auvergne dès le lorsque les programmes régionaux passent de la deuxième à la troisième chaîne.
L'information régionale est diffusée tous les jours de 19 h 10 à 19 h 30 dans le cadre du 19/20 dès 1990.
Avec la création de France Télévision le , FR3 Rhône-Alpes Auvergne devient France 3 Rhône-Alpes Auvergne.
Fin 2009, la direction régionale de France 3 Rhône-Alpes Auvergne couvrait 12 départements et comptait trois rédactions régionales (Lyon, Grenoble et Clermont-Ferrand), quatre éditions locales (Lyon, Saint-Étienne, Grenoble et Clermont-Ferrand), dix bureaux permanents et une unité régionale de production.
Depuis le , une nouvelle organisation de France 3 a été mise en place dans le cadre de l'entreprise unique. L’un des changements majeurs pour France 3 est la suppression de ses 13 directions régionales remplacées par quatre pôles de gouvernance (Nord-Est, Nord-Ouest, Sud Ouest et Sud-est) localisés dans quatre grandes villes de France, celui du Sud-Est ayant été attribué à Marseille. Les régions sont redécoupées en 24 antennes dites de proximité. Les bureaux régionaux d'information de Grenoble et Clermont-Ferrand cessent de dépendre de Lyon, qui a perdu son rôle de direction régionale, pour devenir autonomes. France 3 Rhône-Alpes Auvergne se scinde alors en trois antennes de proximité : France 3 Auvergne, France 3 Rhône-Alpes et France 3 Alpes.
L'édition locale dédiée à l'agglomération clermontoise (Clermont Soir) disparaît à l'été 2011.
Identité visuelle
Le , France 3 dévoile le nouveau logo pour la région Auvergne et l'ensemble de sa rédaction nationale.
Identité visuelle (logo)
Ancien logo de FR3 Rhône-Alpes Auvergne du au .
Ancien logo de France 3 Rhône-Alpes Auvergne du au .
Ancien logo de France 3 Rhône-Alpes Auvergne du au .
Ancien logo de France 3 Rhône-Alpes Auvergne du au .
Seules les émissions comme (les JT, PILS et Dimanches en politiques en Auvergne) sont spécifiques à l'antenne France 3 Auvergne.
Journaux télévisés
Toute l'actualité de l'Auvergne dans : le ici 12/13 et le ici 19/20 .
Laurence Laborie (JT semaine : 12/13)
Charline Collet (JT semaine : 12/13)
Maxime Van Oudendycke (JT semaine : 19/20)
Delphine Cros (JT : 12/13, 19/20)
Fabien Gandilhon (JT
Marie Morin (JT semaine : 19/20)
Camille Da Silva (JT : Week-end)
Richard Beaune (JT : Week-end)
Jean-Luc Roussilhe (Sports)
Magazine
Par ici les sorties (PILS)
C'est l'agenda culturel de France 3 Auvergne diffusé chaque vendredi à 19 heures. Concerts, spectacles de danse, théâtre, rendez-vous culturels, Richard et Valérie passent en revue chaque semaine toutes les sorties de la région.
Richard Beaune
Valérie Mathieu
Dimanche en politiques en Auvergne
C'est le magazine de 26 minutes de débat politique et sociétal, le dimanche à 11 h 30. Il traite des sujets qui font débat et des enjeux politiques, sociaux et sociétaux. Hommes et femmes politiques, citoyens engagés et habitants de la région apportent leurs réponses à la question de la semaine.
Marie Morin
Cyrille Genet
Brigitte Cante
Anciens présentateurs
Jean-Paul Vincent (retraité depuis le 16 octobre 2014[2])
Béatrice N'Guyen (partie à la Rédaction nationale de France 3)
Frédéric Cuvier (parti à France 3 Provence-Alpes : rédacteur en chef adjoint chargé de la locale de Toulon)