En 2005, le groupe TUI acquiert pour 1,7 milliard d'euros, la société canadienneCP Ships. Le groupe devient alors la quatrième plus importante compagnie maritime de porte-conteneurs au niveau mondial.
En , Hapag-Lloyd fusionne avec Compañía Sud Americana de Vapores, les actionnaires de Compañía Sud Americana de Vapores possèdent alors 30 % de la nouvelle société quand TUI n'en possède alors plus que 22 %[1].
En , Hapag-Lloyd annonce l'acquisition par échange d'action d'UASC, créant un nouvel ensemble ayant un chiffre d'affaires d'environ 7 à 8 milliards d'euros, qui sera possédé à 72 % par les actionnaires de Hapag-Lloyd[2]. À la suite de cette acquisition, Hapag-Lloyd annonce la suppression de 12 % de ses 11 000 postes situés à terre ferme, dans le cadre d'une restructuration[3].
Hapag-Lloyd Kreuzfahrten, une flotte de cinq paquebots de croisière : MS Europa ; MS Europa 2 ; Hanseatic Nature ; Hanseatic Inspiration ; Hanseatic Spirit
Hapag-Lloyd Container Linie, une flotte de cinquante-cinq porte-conteneurs, d'une capacité de 226 000 EVP ;
CP Ships, soixante-dix huit porte-conteneurs de capacité de 187 000 EVP.
Autres marques portant le nom d'Hapag-Lloyd
Sous le nom d'Hapag-Lloyd il existe les firmes suivantes :
Ces sociétés ne font pas partie de la société Hapag-Lloyd. Les deux premières sont devenues des filiales du groupe TUI. Quant à HLX, elle a directement été créée par TUI en 2002, en tant que compagnie à bas prix en utilisant un nom déjà connu sur le marché afin d'avoir une plus grande notoriété.