La Coppa dell'Imperatore 1961 è stata la quarantatreesima edizione della coppa nazionale giapponese di calcio.
Rimane invariata la formula degli incontri a eliminazione diretta, con sedici squadre ai nastri di partenza[1]. Nel caso in cui la situazione di parità perduri oltre i tempi supplementari, si ricorre al sorteggio tramite moneta[1].
Tutti gli incontri si sono disputati a Fujieda[1]
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