John Frederick Miller (1759 – 1796) è stato un naturalista e illustratore inglese, soprattutto di soggetti botanici.
Era figlio dell'artista John Sebastian Miller (1715 - 1790 ca.). Miller, assieme al fratello James[1], produsse disegni tratti dagli schizzi fatti da Sydney Parkinson nel corso del primo viaggio di James Cook[2]. Egli stesso accompagnò Joseph Banks in una spedizione in Islanda nel 1772.
La più importante opera di Miller sono i Cimelia Physica. Figures of rare and curious quadrupeds, birds, &c. together with several of the most elegant plants (1796), con testi scritti da George Shaw.
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