La Yüksək dəstə 2003-2004 è stata la 12ª edizione del massimo campionato di calcio azero, disputata tra il 17 maggio 2003 e il 5 maggio 2004 e conclusa con la vittoria del PFC Neftchi Baku, al suo quarto titolo.
Dopo la pausa della stagione precedente a causa dei contrasti tra i club e la federazione in questa stagione le squadre partecipanti furono 15 e avrebbero dovuto disputare un girone di andata e ritorno per un totale di 28 partite ma l'Umid Baku si ritirò dopo l'ottava giornata (con uno score di 1 vittoria, 2 pareggi e 5 sconfitte con 7 gol fatti e 20 subiti) e i suoi risultati furono annullati cosicché le giornate furono 26.
Il Lokomotiv Imisli si ritirò dopo la quindicesima giornata e ai rimanenti incontri fu assegnato lo 0-3 a tavolino. Nessuna altra squadra fu retrocessa in Birinci Divizionu.