高円宮杯U-18サッカーリーグ2016は、高円宮杯U-18サッカーリーグの2016年の大会である。
プレミアリーグのイーストとウエストはそれぞれ、青森山田高校とサンフレッチェ広島ユースが優勝し、チャンピオンシップに出場した。チャンピオンシップでは、青森山田高校が勝ってチャンピオンとなった。プレミアリーグの順位は次のとおり。
プレミアリーグイースト
プレミアリーグウエスト
9位以下の4チームは、翌年のプリンスリーグへ降格した。一方で、プレミアリーグ参入戦で勝ち上がった次の4チームが翌年のプレミアリーグへ昇格した。
都府県リーグと北海道ブロックリーグの優勝チームは次のとおり。
男子 - 女子 - U-23
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