Opgeleid aan de Princeton-universiteit was hij 46 jaar lang tot aan zijn emeritaat als hoogleraar in het Nieuwe Testament aan het Princeton Theological Seminary verbonden. Daarnaast verzorgde hij vele gastcolleges op diverse andere universiteiten in Amerika en daarbuiten.
Metzger ontkende in bepaalde gevallen de historiciteit van de Bijbel. Zo was hij van mening dat de nieuwtestamentische boeken niet door de eerste christenen werden aanvaard omdat zij deze als goddelijk geïnspireerd beschouwden maar omdat ze waren geschreven door christenen van het eerste uur en daardoor voor hen gezaghebbend waren. Vanwege deze opvattingen werd Metzger door bepaalde orthodoxe christenen van vrijzinnigheid beschuldigd.