In 2007 maakte Aguilar zijn opwachting voor Paraguay. Op 17 oktober 2012 maakte hij zijn eerste interlandtreffer in de WK-kwalificatiewedstrijd tegen Peru, het enige doelpunt van de wedstrijd.[5] Eén maand later was Aguilar opnieuw trefzeker in een oefeninterland tegen Guatemala.[6] Op 7 februari 2013 maakte hij zijn derde interlanddoelpunt in het vriendschappelijke treffen met El Salvador.[7]