Indeks geometryczny

W chemii koordynacyjnej, strukturalnej oraz krystalografii indeks geometryczny lub parametr strukturalny jest liczbą w zakresie 0-1, która informuje o geometrii wokół atomu centralnego cząsteczki (zwykle centrum koordynacji). Pierwszy taki parametr dla związków 5-koordynacyjnych został zaproponowany w 1984 roku. Później opracowano również parametry dla związków 4-koordynacyjnych. Opracowana została również aplikacja on-line do wyznaczania indeksów geometrycznych na podstawie strukturalnych plików 3D[1].

Związki 5-koordynacyjne

By ocenić, czy geometria centrum koordynacji o LK = 5 zbliżona jest bardziej do bipiramidy trygonalnej, czy piramidy kwadratowej Addison et al. zaproponowali w 1984 roku parametr (w oryginalnej pracy po prostu )[2]:

gdzie: to dwa największe kąty walencyjne centrum koordynacji.

Gdy parametr jest bliski 0, to geometria zbliżona jest do piramidy kwadratowej, natomiast gdy jest on bliski 1, to geometria zbliża się do bipiramidy trygonalnej:


Związki 4-koordynacyjne

Poprzez analogię, w 2007 roku Yang et al. zaproponowali parametr dla związków o LK = 4, aby ocenić czy ich geometria jest bardziej zbliżona do płaskiej kwadratowej, czy tetraedrycznej[3]:

gdzie: i to dwa największe kąty walencyjne centrum koordynacji; to kąt tetraedryczny.

Gdy parametr jest bliski 0, to geometria jest zbliżona do płaskiej kwadratowej, natomiast gdy jest on bliski 1, to geometria zbliża się do tetraedrycznej. Niestety parametr ten (w przeciwieństwie do ) nie różnicuje kątów i przez co struktury o znacząco różniących się geometriach mogą mieć identyczną wartość parametru By przezwyciężyć tę niedogodność w 2015 roku Okuniewski et al. zaproponowali parametr który przybiera wartości zbliżone do jednak lepiej różnicuje rozpatrywane struktury[4]:

gdzie: to dwa największe kąty walencyjne centrum koordynacji; to kąt tetraedryczny.

Wartości graniczne parametrów i definiują dokładnie te same geometrie skrajne, jednak parametr jest zawsze mniejszy lub równy parametrowi przez co nawet niewielkie odchylenia od geometrii tetraedru są bardziej zauważalne. Jeżeli dla kompleksu tetraedrycznego wartość parametru jest mała, to należy sprawdzić, czy w obrębie centrum koordynacji nie występują dodatkowe oddziaływania. Przykładowo dla kompleksów rtęci(II) udało się w ten sposób odnaleźć oddziaływania Hg···π[5].



Przypisy

  1. Geom [online], kchn.pg.gda.pl [dostęp 2017-11-18] (ang.).
  2. A. W. Addison, N. T. Rao, J. Reedijk, J. van Rijn i inni. Synthesis, structure, and spectroscopic properties of copper(II) compounds containing nitrogen–sulphur donor ligands; the crystal and molecular structure of aqua[1,7-bis(N-methylbenzimidazol-2′-yl)-2,6-dithiaheptane]copper(II) perchlorate. „J. Chem. Soc. Dalton Trans.”, s. 1349, 1984. DOI: 10.1039/dt9840001349. 
  3. L. Yang, D. R. Powell, R. P. Houser. Structural variation in copper(I) complexes with pyridylmethylamide ligands: structural analysis with a new four-coordinate geometry index, . „Dalton Trans.”, s. 955, 2007. DOI: 10.1039/b617136b. 
  4. A. Okuniewski, D. Rosiak, J. Chojnacki, B. Becker. Coordination polymers and molecular structures among complexes of mercury(II) halides with selected 1-benzoylthioureas. „Polyhedron”. 90, s. 47, 2015. DOI: 10.1016/j.poly.2015.01.035. 
  5. D. Rosiak, A. Okuniewski, J. Chojnacki. Novel complexes possessing Hg–(Cl, Br, I)···O=C halogen bonding and unusual Hg2S2(Br/I)4 kernel. The usefulness of structural parameter. „Polyhedron”. 146, s. 35–41, 2018. DOI: 10.1016/j.poly.2018.02.016. 

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
Kembali kehalaman sebelumnya