MMTK

MMTK (ang. Molecular Modelling Toolkit) – zestaw narzędzi programowych do modelowania molekularnego. MMTK jest to oprogramowanie open source z wiodącym językiem Python, do wspomagania powszechnych działań w modelowaniu cząsteczek.

Pakiet zawiera:

  • konstrukcje systemów cząsteczkowych szczególnie dla białek i polinukleotydów
  • Nieskończone systemy dla periodycznych warunków brzegowych
  • geometryczne operacje na współrzędnych
  • Wizualizacje przy użyciu zewnętrznych PDB i VRLM przeglądarek
  • animację dynamicznych trajektorii
  • AMBER 94 oddziaływania polowe z wieloopcyjnym wybieraniem elektrostatycznych interakcji
  • siłowe pola deformacyjne dla szybkich NM obliczeń dla polipeptydów
  • minimalizacje energii w wersjach: stopniowej i ciągłej
  • Molekularną dynamikę z wyborem ustaleń termostatycznych, barostatycznych i odległościowych
  • NM profil analizy
  • operacje torów
  • dopasowywanie ładunków punktowych
  • obliczanie powierzchni cząsteczek
  • IO sprzężenie do innych programów

Linki zewnętrzne

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
Kembali kehalaman sebelumnya