Protein Data Bank

Protein Data Bank, w skrócie PDB jest to biologiczna baza danych gromadząca dane o strukturze przestrzennej białek i kwasów nukleinowych.

Dane o tych makrocząsteczkach uzyskane m.in. za pomocą rentgenografii strukturalnej i spektroskopii NMR zawierają bibliografię, sekwencje aminokwasowe, informacje o strukturze drugorzędowej oraz, przede wszystkim, współrzędne atomów.

Na dzień 26 października 2020 r. baza PDB zawierała 170 171 następujących struktur[1]:

Metoda Białka Kwasy nukleinowe Kompleksy
białko/kwas nukleinowy
Inne W sumie
Rentgenografia strukturalna 141 144 2 158 7 188 4 150 494
Spektroskopia NMR 11 519 1 362 265 8 13 154
Mikroskopia elektronowa 4 491 47 1 478 0 6 016
Metody mieszane 167 6 3 1 177
Inne 307 4 6 13 330
W sumie 157 628 3 3577 8 940 27 170 171
Przykłady modeli strukturalnych białek z PDB

Przypisy

  1. PDB Current Holdings Breakdown. Research Collaboratory for Structural Bioinformatics. [dostęp 2020-10-26]. [zarchiwizowane z tego adresu (2007-07-04)].

Linki zewnętrzne

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
Kembali kehalaman sebelumnya