ZINC
ZINC (akronim rekurencyjny od ang. ZINC is not commercial) – darmowa baza danych dostępnych handlowo struktur chemicznych, dostępna on-line. Jej głównym przeznaczeniem jest użycie zdeponowanych tam struktur w screeningu wirtualnym. Baza prowadzona jest przez Shoichet Laboratory Uniwersytetu Kalifornijskiego w San Francisco (UCSF).
Zawartość
Baza ZINC gromadzi struktury związków chemicznych dostępnych handlowo u różnych dostawców. Przed importem do bazy struktury są filtrowane w celu odrzucenia związków niespełniających reguł chemii medycznej (np. zbyt duża masa molowa, obecność reaktywnych grup chemicznych itp). Dla każdej cząsteczki generowana jest jej struktura trójwymiarowa, protonowana w trzech warunkach pH: kwaśnym, obojętnym i zasadowym.
Zawartość bazy dostępna jest zarówno w zestawach (ang. subsets), dobieranych według różnych kryteriów (np. parametrów fizykochemicznych)[1] jak i poprzez wyszukiwarkę struktur[2].
Struktury związków dostępne są w różnych formatach: SMILES, mol2, SDF i flexibase.
Statystyki
Na dzień 2013-01-11 baza ZINC zawierała 19607982 struktur[1]. Tygodniowo przybywa ok. 40 tys. nowych cząsteczek[3]. Miesięcznie pobieranych jest 1–2 TB danych.
Przypisy
- ↑ a b Physical Property Subsets. [dostęp 2013-03-30]. [zarchiwizowane z tego adresu (2013-03-07)].
- ↑ Structure search. [dostęp 2013-03-30]. [zarchiwizowane z tego adresu (2013-03-12)].
- ↑ ZINC wiki. [dostęp 2013-03-30]. [zarchiwizowane z tego adresu (2013-04-29)].
Linki zewnętrzne
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.