Os Beta-CoVs de maior importância clínica para seres humanos são OC43 e HKU1 da linhagem A, SARS-CoV e SARS-CoV-2 da linhagem B,[1] e MERS-CoV da linhagem C. O MERS-CoV é o primeiro betacoronavírus pertencente à linhagem C que é conhecido por infectar seres humanos.[2][3]
Os vírus alfa e betacoronavírus infetam principalmente os morcegos, mas também infetam outras espécies, como seres humanos, camelos e coelhos.[7][8][9][10] Beta-CoVs que causaram epidemias em humanos geralmente induzem febre e sintomas respiratórios. Eles incluem:
Os coronavírus têm um grande tamanho de genoma que varia de 26 a 32 kilobases.
Em maio de 2013, o GenBank publicou 46 genomas completos dos CoVs α- (grupo 1), β- (grupo 2), γ- (grupo 3) e δ- (grupo 4).[11]
Classificação
Diagrama da estrutura do virion do coronavírus mostrando picos que formam a "coroa" como a coroa solar, daí o nome.
Dentro do gênero betacoronavírus (Grupo 2 CoV), quatro linhagens (A, B, C e D) são comumente reconhecidas.
A linhagem A inclui HCoV-OC43 e HCoV-HKU1 (várias espécies).
A linhagem B inclui SARS-CoV (várias espécies) e 2019-nCoV.
A linhagem C inclui coronavírus de morcego Tylonycteris HKU4 (BtCoV-HKU4), coronavírus de morcego Pipistrellus HKU5 (BtCoV-HKU5) e MERS-CoV (várias espécies).
A linhagem D inclui o coronavírus de morcego Rousettus HKU9 (BtCoV-HKU9).[12]
As quatro linhagens também são nomeadas usando letras gregas ou numericamente.[13]
Morfologia
ilustração da SARSr-CoV
Os vírus da linhagem A diferem de todos os outros do gênero, pois possuem uma proteína mais curta, chamada hemaglutinina esterase (HE).
O nome coronavírus é derivado do latim "corona", que significa coroa, referindo-se à sua imagem sob microscopia eletrônica de espigões semelhantes a coroas em sua superfície, e semelhante à coroa solar. Essa morfologia é criada pelos peplômeros do pico viral peplômero, que são proteínas que povoam a superfície do vírus e determinam o tropismo do hospedeiro. A ordem nidovirales é nomeada para o latim nidus, que significa ninho. Refere-se à produção desta ordem de um conjunto aninhado coterminal 3 de mRNAs subgenômicos durante a infeção.[14]
Várias estruturas das proteínas spike foram resolvidas. O domínio de ligação ao receptor na proteína de pico de alfa e betacoronavírus é classificado como InterPro.[15] Os monta proteína espigão num trímero ( ]PDB3jcl); sua estrutura principal se assemelha à das proteínas paramixovírus F (fusão).[16]
↑«Family Cluster of Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus Infections». New England Journal of Medicine. 368: 2487–94. 2013. PMID23718156. doi:10.1056/NEJMoa1303729