↑ Количество игр и голов за профессиональный клуб считается только для различных лиг национальных чемпионатов, обновлено по состоянию на 4 июня 2023 года.
Николас Агирре начинал свою профессиональную карьеру игрока в аргентинском клубе «Арсенал» из Саранди. 9 ноября 2008 года он дебютировал в аргентинской Примере, выйдя на замену во втором тайме домашнего матча против «Боки Хуниорс»[3]. 29 марта 2010 года Агирре забил свой первый гол на высшем уровне, оказавшийся единственным и победным в домашнем поединке с «Сан-Лоренсо»[4]. Сезон 2010/11 он провёл в клубе Примеры B Насьональ «Атлетико Рафаэла»
В составе «Арсенала» Николас Агирре выигрывал чемпионат и Суперкубок Аргентины в 2012 году и Кубок Аргентины в 2013 году. В феврале 2015 года он перешёл в «Ланус», в составе которого стал в сезоне 2016 чемпионом Аргентины, являясь игроком основного состава.