Молодёжная сборная Кыргызстана по футболу была создана в 1991 году. Главный тренер — Максим Лисицын. В 2018 году сборная впервые вышла в финальную стадию Кубка Азии[1].
Молодёжная сборная, составленная из игроков до 21 года, дважды выступала в Высшей лиге Кыргызстана — в 2004 и 2005 годах. Результаты выступления: 2004 — последнее место (10 место), 2005 — предпоследнее (7 место).
Участие в Кубках Содружества
В 2012 году молодёжная сборная Кыргызстана впервые приняла участие в Кубке Содружества, где заняла последнее, четвёртое место в своей группе, проиграв молодёжным сборным Латвии (2:3), Украины (0:4) и Молдавии (1:2). В турнире за 9-12 места киргизская команда обыграла сборные Туркменистана (3:1), Таджикистана (3:1) и Эстонии (2:0) и заняла девятое место. Ключевыми игроками того состава были Мирлан Мурзаев и Турсунали Рустамов.
На Кубке Содружества 2013 молодёжная сборная Кыргызстана также не вышла из группы проиграв Казахстану (1:3), успешно сыграв вничью с Россией (0:0) и Узбекистаном (2:2), причём в игре с узбеками вела в счёте по ходу матча. Таким образом команда Кыргызстана не вышла из группы. В матчах за 9-12 место молодёжная сборная Кыргызстана обыграла Латвию по серии послематчевых пенальти (6:4), затем в матче за девятое место также по пенальти обыграла Эстонию (4:3).
На турнире 2014 года команда Кыргызстана заняла последнее место. В групповом турнире сборная сыграла вничью с Таджикистаном, а другие два матча проиграла, также был проигран первый матч «утешительного турнира» против сборной Москвы. В матче за 11-е место Кыргызстан уступил по пенальти Таджикистану.
Наивысшего успеха сборная Кыргызстана добилась в розыгрыше 2015 года. Победив в групповом турнире молодёжную сборную России (2:1), команда впервые вышла в плей-офф турнира[2], где в четвертьфинале проиграла Финляндии. В матче за 5-6 место соперником снова стала Россия, которая в этой игре взяла реванш и в итоге Кыргызстан занял шестое место.
В 2016 году киргизская команда стала четвёртой[3].