У дорослому футболі дебютував 1927 року виступами за команду клубу «Удінезе», в якій провів два сезони.
Згодом з 1929 по 1934 рік грав у складі команд клубів «Лаціо» та «Падова».
1934 року перейшов до клубу «Ювентус», за який відіграв 13 сезонів. Більшість часу, проведеного у складі «Ювентуса», був основним гравцем захисту команди. Завершив професійну кар'єру футболіста виступами за команду «Ювентус» у 1947 році
Виступи за збірну
1936 року дебютував в офіційних матчах у складі національної збірної Італії. Протягом кар'єри у національній команді, яка тривала 7 років, провів у формі головної команди країни 23 матчі.
Протягом 1954—1958 входив до тренерської ради, яка опікувалася підготовкою національної збірної Італії, а у 1964—1967 роках італійський спеціаліст очолював тренерський штаб національної збірної Швейцарії. Очолювані Фоні швейцарці успішно подолали кваліфікаційний турнир для участі у чемпіонату світу 1966 року в Англії, однак безпосередньо в рамках фінального турніру виступили невдало, програвши усі три матчі групового етапу із загальним рахунком 1:9.
Останнім місцем тренерської роботи був швейцарський клуб «Лугано», команду якого Альфредо Фоні очолював як головний тренер до 1977 року.