З 1997 року проходив службу на посадах командира танкового полку, командира механізованого полку, начальника штабу — першого заступника командира танкової дивізії Північного оперативного командування в Збройних силах України.
Наказом Міністра оборони України (по особовому складу) від 10 травня 2012 року № 358 призначений на посаду заступника начальника Генерального штабу Збройних Сил України.
13 червня Юрій Луценко повідомив, що у бою 12 червня під Сніжним Віктор Муженко геройськи проявив себе, особисто очоливши атаку. За його словами, це додало впевненості військам, а супротивник зазнав втрат.[8]
3 липня 2014 року призначений Начальником Генерального штабу — Головнокомандувачем Збройних Сил України, змінивши на посаді Михайла Куцина[9][10]. На думку Юрія Бутусова, з 20 травня 2014, коли Муженко був призначений заступником керівника Антитерористичного центру при СБУ і до призначення Начальником Генштабу, Муженко був фактичним керівником АТО[11].
29 липня Юрій Бутусов написав, що Муженко особисто повів на прорив ударне угруповання військ у Секторі Д.[12]
23 серпня 2014 року присвоєно військове звання генерал-полковника[13][14].
12 вересня 2014 року був позбавлений статусу командувача Антитерористичною операцією у зв'язку з подіями навколо Іловайська. Обов'язки командувача військами АТО були передані першому заступнику начальника Генштабу Геннадію Воробйову[15].
2 вересня 2019 року Президент України Володимир Зеленський указом №645/2019 звільнив Віктора Муженка з військової служби у зв'язку з проведенням організаційних заходів з правом носіння військової форми одягу.[20][21]
Подальша кар'єра
В інтерв'ю виданням Факти та коментарі та BBC News, які вийшли друком на початку березня та травня 2021 року відповідно Віктор Муженко зазначав, що на той момент він працював в Центрі воєнно-стратегічних досліджень Національного університету оборони та науково-дослідному інституті ЗСУ.[22][23]
З 24 лютого по другу половину квітня 2022 року працював на пункті управління Генштабу[24]. 24 лютого 2022 року головнокомандувач ЗСУ Валерій Залужний оприлюднив фото, де він разом з Віктором Муженком працює над картами в Генштабі.[25]
За інформацією видавництва Факти та коментарі, станом на 15 березня 2023 року - провідний науковий співробітник науково-дослідного інституту ЗСУ.[24]
На сьогоднішній день ми маємо тільки факти участі окремих військовослужбовців Збройних сил РФ, громадян РФ в складі незаконних збройних формувань у бойових діях. Бойових дій з підрозділами регулярної російської армії на сьогоднішній день ми теж не ведемо. У нас достатньо сил та засобів для того, щоб нанести остаточне навіть ураження незаконним збройним формуванням.
— Віктор Муженко, 29 січня 2015.
17 квітня 2015 року Віктор Муженко зробив заяву, що станом на січень ще не було задокументованих доказів прямих зіткнень з військовими частинами Росії, проте у лютому регулярні підрозділи Збройних сил РФ брали безпосередню участь у боях під Дебальцевим, Чорнухиним та Логвиновим:[28][29][30][31]
Зараз я вже можу говорити про те, що в цих боях українська армія завдала важких втрат саме російській армії, і зірвала її агресивні плани подальшого наступу.
— Віктор Муженко, 17 квітня 2015.
Родина
Одружений, має сина та доньку.
Нагороди та відзнаки
Орден Богдана Хмельницького III ст. (4 липня 2016) — за особисту мужність і високий професіоналізм, виявлені у захисті державного суверенітету та територіальної цілісності України, вірність військовій присязі[32][33]
Орден Данила Галицького (27 травня 2004) — за мужність і самовідданість, виявлені під час виконання військового обов'язку, вагомий внесок у підтримання миру і стабільності у різних регіонах світу[34]
Медаль «За бездоганну службу» III ст. (14 вересня 2001) — за вагомий особистий внесок у забезпечення обороноздатності України, високий професіоналізм та з нагоди 60-річчя від дня створення 30 гвардійської танкової дивізії 8 армійського корпусу Північного оперативного командування[35]
Окремі журналісти та політики звинувачували Муженка у невдачах українського війська на початковому етапі російсько-української війни.[36][37].
В інтерв'ю виданню Факти та коментарі 18 квітня 2021 року Філіп Брідлав відзначив внесок Віктора Муженка у реформування ЗСУ: "Безумовно, я згоден з тим, що українська армія зразка 2021 року разюче відрізняється від того, що я бачив навесні 2014-го (я тоді неодноразово бував в Україні). Вважаю, що в цьому найбільша заслуга командування ЗСУ, в тому числі і мого друга генерала Віктора Муженка."[38]
24 лютого 2022 року головнокомандувач ЗСУ Валерій Залужний подякував екс-голові Генштабу Віктору Муженку за участь в обороні України: "Вдячний за підтримку і безцінний досвід своєму попереднику генералу Армії Віктор Муженко"[25]
Кримінальне переслідування в Росії
10 вересня 2015 року Слідчий комітет Російської Федерації порушив кримінальну справу стосовно начальника Генерального штабу Збройних сил України Віктора Муженка за підозрою в застосуванні заборонених засобів і методів ведення війни і геноциді (ч.1 ст.356, ст.357 Кримінального кодексу РФ). Згідно з повідомленням прес-служби комітету, в період з 31 травня по 1 вересня 2014 невстановлені особи з числа військовослужбовців Збройних сил України та Національної гвардії України, виконуючи накази Муженка, здійснили прицільні артилерійські обстріли з важких видів озброєння (калібру не менше 122 мм) об'єктів цивільної інфраструктури, які не є військовими цілями в населених пунктах самопроголошеної «Донецької народної республіки». Слідчий комітет Росії стверджує, що в результаті артилерійських обстрілів загинуло 45 осіб, отримали поранення більше 160 осіб, зруйновано або частково знищено не менше 163 об'єктів, у тому числі житлові будинки, будівля суду і підстанція шахти[39].
Режисер Ахтем Сеїтаблаєв в інтерв'ю виданню Новинарня відзначив допомогу Генерального штабу і Віктора Муженка в створенні фільму «Кіборги»[40][значущість факту?].