TFAP4
TFAP4
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| TFAP4, AP-4, bHLHc41, transcription factor AP-4 (activating enhancer binding protein 4), transcription factor AP-4 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 600743 MGI: 103239 HomoloGene: 2424 GeneCards: TFAP4
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • protein homodimerization activity • protein dimerization activity • GO:0001105 transcription coactivator activity • histone deacetylase binding • protein heterodimerization activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • DNA binding • E-box binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
|
---|
Клітинна компонента |
• transcription repressor complex • клітинне ядро • мітохондрія
|
---|
Біологічний процес |
• negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity • transcription, DNA-templated • negative regulation of gene expression • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator • cellular response to dexamethasone stimulus • negative regulation of DNA binding • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway • positive regulation of apoptotic process • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of mitotic cell cycle phase transition • GO:0034622 protein-containing complex assembly • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | | Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
| Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 16: 4.26 – 4.27 Mb
| Хр. 16: 4.36 – 4.38 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані | |
TFAP4 (англ. Transcription factor AP-4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 338 амінокислот, а молекулярна маса — 38 726[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MEYFMVPTQK | | VPSLQHFRKT | | EKEVIGGLCS | | LANIPLTPET | | QRDQERRIRR |
EIANSNERRR | | MQSINAGFQS | | LKTLIPHTDG | | EKLSKAAILQ | | QTAEYIFSLE |
QEKTRLLQQN | | TQLKRFIQEL | | SGSSPKRRRA | | EDKDEGIGSP | | DIWEDEKAED |
LRREMIELRQ | | QLDKERSVRM | | MLEEQVRSLE | | AHMYPEKLKV | | IAQQVQLQQQ |
QEQVRLLHQE | | KLEREQQQLR | | TQLLPPPAPT | | HHPTVIVPAP | | PPPPSHHINV |
VTMGPSSVIN | | SVSTSRQNLD | | TIVQAIQHIE | | GTQEKQELEE | | EQRRAVIVKP |
VRSCPEAPTS | | DTASDSEASD | | SDAMDQSREE | | PSGDGELP |
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
Література
Примітки
Див. також
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
| (2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
| (3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
| (4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
| (0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|
|
|