1867 року її наречений, студент медицини, розірвав заручини і одружився з Надією Сусловою (1843—1918). У відповідь вона присвятила себе вивченню медицини в університеті Цюриха, який був першим медичним факультетом в Європі, що приймав на навчання жінок. Це викликало національний скандал[5], оскільки раніше туди зараховували тільки іноземок (таких, як росіянка Н. Суслова) (імматрикуляція[en]).
Після складання іспитів з відзнакою[6] вона вивчала гінекологію в Лейпцигу і працювала в Дрездені в пологовому будинку. 11 липня 1874 вона здобула докторський ступінь в Цюрихському університеті з дисертацією на тему про вплив праці на стан жіночої статевої системи. Для отримання офіційного дозволу на медичну практику в Цюриху знадобилося втручання її батька.
Професійне і сімейне життя
Хоча її практика почалася з кількох клієнтів, вона незабаром здобула репутацію здібного і хорошого лікаря, особливо відзначали її щедрість стосовно бідних жінок.
1875 року вона вийшла заміж за відомого геолога Альберта Гайма, після того, як він дав їй свій дозвіл (за тогочасним законом) продовжувати працювати після вступу до шлюбу. У пари було двоє дітей, Арнольд і Гелен, а також прийомна дитина.
Müller, Verena E. Kampf und Krampf : [] // Libernensis, Zeitschrift der Universitätsbibliothek Bern. — University Library of Berne. — № 1/2008. — С. 26. — ISSN1660-2439.
Müller, Verena E. Marie Heim-Vögtlin – die erste Schweizer Ärztin (1845–1916): Ein Leben zwischen Tradition und Aufbruch : [нім.]. — 2nd. — hier+jetzt Verlag, 2008. — ISBN 978-3-03919-061-4.
Siebel, Johanna. Das Leben von Frau Dr. Marie Heim-Vögtlin, der ersten Schweizer Ärztin : [нім.]. — Leipzig : Rascher, 1925.