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日本在世界動物地理分區上絕大部份屬於舊北區,除了琉球群島屬於東洋區外。約有600種鳥類被紀錄,其中有13種為特有種,7種為只在日本繁殖的種類。
根據日本鳥學會的分類:
第3類分類不列於此表,因此本表只有565種鳥類。