Il commence à travailler comme analyse à la direction générale de l'Analyse macro-économique du ministère de l'Économie et des Finances. En , il rejoint la direction générale des Affaires économiques et financières de la Commission européenne, où il est expert national dans le secteur du suivi et de l'analyse du marche immobilier et de l'endettement du secteur privé[4].
Il revient en Espagne en , pour occuper le poste de sous-directeur général de l'Endettement public de l'Autorité indépendante de responsabilité fiscale (AIReF), alors présidée par José Luis Escrivá. Il devient ensuite directeur de la division de l'Analyse économique[4]. À ce titre, il remarque en que le plan budgétaire pour 2020 envoyé à la Commission européenne contient une erreur à hauteur de 7 milliards € en matière de dépenses globales, ce dont il informe le ministère de l'Économie, qui reconnaît l'erreur et la corrige auprès de Bruxelles[5].
Il est promu secrétaire général du Trésor et du Financement international en [7]. Il devient alors le bras droit de la ministre Nadia Calviño, qu'il accompagne lors des réunions du conseil Ecofin, au Fonds monétaire international (FMI) et du G20[8].
↑ abc et d(es) Khadija Bousmaha, « Carlos Cuerpo Caballero, nuevo ministro de Economía, Comercio y Empresa en sustitución de Nadia Calviño », La Sexta, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) CARLOS SEGOVIA, « Sánchez asciende al 'número tres' de Economía Carlos Cuerpo tras no lograr fichar a economistas de fuera del Gobierno », El Mundo, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) Raúl Piña, « Sánchez nombra a Carlos Cuerpo ministro de Economía y refuerza a Montero como vicepresidenta primera », El Mundo, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) Carlos Segovia, « Carlos Cuerpo, el favorito de Calviño al que fichó tras detectar una "errata" de 7.000 millones en un plan enviado a la UE », El Mundo, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) EFE, « Este es el consejo de sabios que asesora al Gobierno en la desescalada », Público, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) « El extremeño Carlos Cuerpo, nuevo secretario general del Tesoro », ElDiario.es, (lire en ligne, consulté le ).
↑ a et b(es) Antonio Maqueda, « Carlos Cuerpo, un perfil técnico para negociar con Bruselas », El País, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) Antonio Maqueda et Jesús Sérvulo González, « María Jesús Montero asciende a vicepresidenta primera y Carlos Cuerpo será el nuevo ministro de Economía tras la salida de Nadia Calviño », El País, (lire en ligne, consulté le ).
↑(es) « Carlos Cuerpo, María Jesús Montero y José Luis Escrivá prometen sus cargos ante el rey en Zarzuela », Onda Cero, (lire en ligne, consulté le ).