Lo Slovak Challenger 2006 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 2006. Il torneo si è giocato a Bratislava in Slovacchia dal 25 settembre al 1º ottobre 2006 su campi in cemento indoor.
Vincitori
Singolare
Iván Navarro ha battuto in finale
Teodor-Dacian Craciun 6-2, 7–6(4)
Doppio
Flavio Cipolla /
Marcel Granollers hanno battuto in finale
David Marrero /
Pablo Santos 7–6(2), 6-4
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