Lo Zagreb Open 2006 è stato un torneo di tennis facente parte della categoria ATP Challenger Series nell'ambito dell'ATP Challenger Series 2006. Il torneo si è giocato a Zagabria in Croazia dal 15 al 21 maggio 2006 su campi in terra rossa.
Vincitori
Singolare
Daniel Elsner ha battuto in finale
Victor Crivoi 4–6, 6–1, 6–2
Doppio
Yves Allegro /
Michal Mertiňák hanno battuto in finale
Julien Jeanpierre /
Nicolas Renavand 6–1, 6–2
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